Метаболические карты

Пояснения

В этом разделе приведены 13 метаболических карт, на которых в компактной и схематической форме представлены основные метаболические пути. Карты не сопровождаются какими-либо дополнительными пояснениями.

1. Цикл Кальвина (хлоропласты)
2. Углеводный обмен
3. Биосинтез жиров и мембранных липидов
4. Биосинтез кетоновых тел и стероидов
5. Распад жиров и фосфолипидов (ферментативная деградация)
6. Биосинтез незаменимых аминокислот
7. Биосинтез заменимых аминокислот
8. Деградация аминокислот (карта I)
9. Деградация аминокислот (карта II)
10. Конверсия аммиака
11. Биосинтез пуриновых нуклетидов
12. Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов и перенос C₁-фрагментов
13. Распад мононуклетидов

Метаболические карты:

— содержат описание метаболических путей, которые в основной части книги по причине экономии места приведены в общем виде. В особенности это касается путей биосинтеза и деградации аминокислот и нуклеотидов, и отчасти углеводного и липидного обмена;

— позволяют получить полное представление о конкретном метаболическом пути, образующихся промежуточных и конечных соединениях, а также о ферментах, катализирующих биохимические реакции;

— могут служить справочным материалом, позволяющим определить место известных веществ в метаболических путях.

Важнейшие промежуточные соединения на схемах пронумерованы. Соответствующие соединения можно легко идентифицировать с помощью сопутствующей таблицы.

Для каждой биохимической реакции приводится классификационный код соответствующего фермента. Названия и коды ферментов приведены также в систематизированном списке ферментов, в котором все упомянутые в тексте ферменты расположены в соответствии с их кодом. Для идентификации ферментов рекомендуется также пользоваться предметным указателем.

Для реакций с участием коферментов приводятся названия коферментов (частично в тривиальном варианте). Для наиболее важных начальных, промежуточных и конечных соединений приведены полные названия или формулы.

Пример

На первой метаболической карте наверху слева приведён начальный этап темновой реакции фотосинтеза (цикл Кальвина).

Согласно этой реакции из одной молекулы рибулозо-1,5-дифосфата (метаболит 1) и одной молекулы CO₂ (метаболит 2) образуются две молекулы 3-фосфоглицерата (метаболит 3).

Код соответствующего фермента 4.1.1.39. Из списка ферментов следует, что речь идёт о рибулозо дифосфат-карбоксилазе/оксигеназе (РДФКО, «рубиско» или 3-фосфо-D-глицерат-карбоксилазе), ключевом ферменте восстановительного пентозо-фосфатного цикла ассимиляции углерода при автотрофии. РДФКО принадлежит к классу 4 (лиазы) и в пределах этой группы к подклассу 4.1 (карбоксилиазы). В качестве кофактора фермент содержит медь ([Cu]).

Структура:

• Главы
• Разделы
• Метаболические карты

Списки:

• Термины
• Ферменты
• Сокращения

Сложность материала:

• Основы биохимии
• Справочные сведения
• Для углублённого изучения

Величины и единицы:

• Основные единицы СИ
• Производные величины
• Множители и приставки для кратных и дольных единиц
• Базовые константы