Метаболические карты

Пояснения

В этом разделе приведены 13 метаболических карт, на которых в компактной и схематической форме представлены основные метаболические пути. Карты не сопровождаются какими-либо дополнительными пояснениями.

  1. Цикл Кальвина (хлоропласты)
  2. Углеводный обмен
  3. Биосинтез жиров и мембранных липидов
  4. Биосинтез кетоновых тел и стероидов
  5. Распад жиров и фосфолипидов (ферментативная деградация)
  6. Биосинтез незаменимых аминокислот
  7. Биосинтез заменимых аминокислот
  8. Деградация аминокислот (карта I)
  9. Деградация аминокислот (карта II)
  10. Конверсия аммиака
  11. Биосинтез пуриновых нуклетидов
  12. Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов и перенос C1-фрагментов
  13. Распад мононуклетидов

Метаболические карты:

— содержат описание метаболических путей, которые в основной части книги по причине экономии места приведены в общем виде. В особенности это касается путей биосинтеза и деградации аминокислот и нуклеотидов, и отчасти углеводного и липидного обмена;

— позволяют получить полное представление о конкретном метаболическом пути, образующихся промежуточных и конечных соединениях, а также о ферментах, катализирующих биохимические реакции;

— могут служить справочным материалом, позволяющим определить место известных веществ в метаболических путях.

Важнейшие промежуточные соединения на схемах пронумерованы. Соответствующие соединения можно легко идентифицировать с помощью сопутствующей таблицы.

Для каждой биохимической реакции приводится классификационный код соответствующего фермента. Названия и коды ферментов приведены также в систематизированном списке ферментов, в котором все упомянутые в тексте ферменты расположены в соответствии с их кодом. Для идентификации ферментов рекомендуется также пользоваться предметным указателем.

Для реакций с участием коферментов приводятся названия коферментов (частично в тривиальном варианте). Для наиболее важных начальных, промежуточных и конечных соединений приведены полные названия или формулы.

Пример

На первой метаболической карте наверху слева приведён начальный этап темновой реакции фотосинтеза (цикл Кальвина).

пример метаболической карты

Согласно этой реакции из одной молекулы рибулозо-1,5-дифосфата (метаболит 1) и одной молекулы CO2 (метаболит 2) образуются две молекулы 3-фосфоглицерата (метаболит 3).

Код соответствующего фермента 4.1.1.39. Из списка ферментов следует, что речь идёт о рибулозо дифосфат-карбоксилазе/оксигеназе (РДФКО, «рубиско» или 3-фосфо-D-глицерат-карбоксилазе), ключевом ферменте восстановительного пентозо-фосфатного цикла ассимиляции углерода при автотрофии. РДФКО принадлежит к классу 4 (лиазы) и в пределах этой группы к подклассу 4.1 (карбоксилиазы). В качестве кофактора фермент содержит медь ([Cu]).


Вычислительные устройства в биологии и медицине / В книге обобщён большой опыт, накопленный за последние годы в области применения математических методов и современной вычислительной техники в биологии и медицине. Книга состоит из трёх частей: 1. Общие сведения о применении вычислительной техники в биологии и медицине (обзор и сравнительная оценка Вычислительные устройства в биологии и медицине
В книге обобщён большой опыт, накопленный за последние годы в области применения ...
Иммунология. Терминологический словарь / Впервые в русскоязычной литературе системно изложены и даны толкования более 1 600 используемых в современной иммунологии и иммунопатологии терминов, иммунобиологических процессов и явлений. Описаны молекулы (иммуноглобулины, цитокины, хемокины, белки системы комплемента, рецепторы, CD- и HLA-антигеИммунология. Терминологический словарь
Впервые в русскоязычной литературе системно изложены и даны толкования более 1 600 ...
Открытие основных законов жизни / В книге изложены история развития и основные достижения молекулярной биологии — от открытия живой клетки до выяснения механизмов биосинтеза белка, строения и функционирования генов. Рассмотрены перспективы дальнейшего развития молекулярной биологии и значение её достижений для расшифровки таких сложОткрытие основных законов жизни
В книге изложены история развития и основные достижения молекулярной биологии — ...
Биоэнергетика. Введение в хемиосмотическую теорию / Книга известного английского биохимика посвящена хемиосмотической теории, создатель которой П. Митчелл был удостоен в 1978 г. Нобелевской премии. Рассмотрены принципы энергетических превращений, происходящих в биологических мембранах, дана краткая характеристика клеточных структур (митохондрий, хлорБиоэнергетика. Введение в хемиосмотическую теорию
Книга известного английского биохимика посвящена хемиосмотической теории, ...