При исследовании синтетических молекул ДНК было показано, что ДНК может принимать различные конформации. Наиболее часто встречается приведённая здесь В-форма ДНК. Как отмечалось на с. Деградация нуклеотидов, молекула состоит из двух антипараллельных полидезоксинуклеотидных цепей, которые закручены в правую двойную спираль.
Остов этого тяжа образован остатками дезоксирибозы и фосфатными группировками, соединёнными фосфодиэфирными связями. Остов одной цепи выделен тёмно-синим цветом, другой — синим, а основания обеих цепей — голубым. Ароматические кольца отстоят друг от друга на 0,34 нм и почти перпендикулярны оси спирали. Каждое основание повёрнуто по отношению к предыдущему на 35°. На каждый виток двойной спирали (360°) приходится примерно 10 пар оснований, ход спирали — 3,4 нм. Между остовами двух отдельных цепей имеются две широкие бороздки. Большая бороздка видна на модели снизу и сверху, малая бороздка — в центре. ДНК-ассоциированные белки (см. Рибосомы: элонгация, терминация, Механизм действия липофильных гормонов) взаимодействуют с наиболее доступными основаниями в области большой бороздки. Пространственные соотношения между остовом и основаниями более наглядно видны на модели одинарной цепи (справа). На всех моделях аденин окрашен в жёлтый цвет, а комплементарный ему тимин — в оранжевый. На виде сверху (в центре; одна цепь выше другой) основания просматриваются наиболее полно.
В определённых условиях ДНК может принимать А-конформацию (на схеме не приведена). При таком расположении сохраняется правая двойная спираль, однако в отличие от В-формы основания уже не перпендикулярны оси, а находятся под другим углом. В Z-конформации (на схеме не приведена), которая может образовываться в участках В-ДНК, богатых GC, расположение нуклеотидов совершенно иное: двойная спираль скручена влево, а остов имеет характерную зигзагообразную форму (отсюда Z-конформация, или Z-ДНК).
Остов этого тяжа образован остатками дезоксирибозы и фосфатными группировками, соединёнными фосфодиэфирными связями. Остов одной цепи выделен тёмно-синим цветом, другой — синим, а основания обеих цепей — голубым. Ароматические кольца отстоят друг от друга на 0,34 нм и почти перпендикулярны оси спирали. Каждое основание повёрнуто по отношению к предыдущему на 35°. На каждый виток двойной спирали (360°) приходится примерно 10 пар оснований, ход спирали — 3,4 нм. Между остовами двух отдельных цепей имеются две широкие бороздки. Большая бороздка видна на модели снизу и сверху, малая бороздка — в центре. ДНК-ассоциированные белки (см. Рибосомы: элонгация, терминация, Механизм действия липофильных гормонов) взаимодействуют с наиболее доступными основаниями в области большой бороздки. Пространственные соотношения между остовом и основаниями более наглядно видны на модели одинарной цепи (справа). На всех моделях аденин окрашен в жёлтый цвет, а комплементарный ему тимин — в оранжевый. На виде сверху (в центре; одна цепь выше другой) основания просматриваются наиболее полно.
В определённых условиях ДНК может принимать А-конформацию (на схеме не приведена). При таком расположении сохраняется правая двойная спираль, однако в отличие от В-формы основания уже не перпендикулярны оси, а находятся под другим углом. В Z-конформации (на схеме не приведена), которая может образовываться в участках В-ДНК, богатых GC, расположение нуклеотидов совершенно иное: двойная спираль скручена влево, а остов имеет характерную зигзагообразную форму (отсюда Z-конформация, или Z-ДНК).
Статьи раздела «Молекулярные модели ДНК и тРНК»:
Структура:
Списки:
Сложность материала:
Величины и единицы:
Книги Список книг
Microarray Image Analysis: An Algorithmic Approach (Chapman & Hall/CRC Computer Science & Data Analysis) To harness the high-throughput potential of DNA microarray technology, it is crucial that the analysis stages of the process are decoupled from the ...
Анализ биологических последовательностей Предлагаемая книга отражает современное состояние сравнительно новой, но весьма ...
Биологическая химия Учебник состоит из четырёх частей, включающих 15 глав, в которых изложены вопросы ...