А. В-ДНК

При исследовании синтетических молекул ДНК было показано, что ДНК может принимать различные конформации. Наиболее часто встречается приведённая здесь В-форма ДНК. Как отмечалось на с. Деградация нуклеотидов, молекула состоит из двух антипараллельных полидезоксинуклеотидных цепей, которые закручены в правую двойную спираль.

Остов этого тяжа образован остатками дезоксирибозы и фосфатными группировками, соединёнными фосфодиэфирными связями. Остов одной цепи выделен тёмно-синим цветом, другой — синим, а основания обеих цепей — голубым. Ароматические кольца отстоят друг от друга на 0,34 нм и почти перпендикулярны оси спирали. Каждое основание повёрнуто по отношению к предыдущему на 35°. На каждый виток двойной спирали (360°) приходится примерно 10 пар оснований, ход спирали — 3,4 нм. Между остовами двух отдельных цепей имеются две широкие бороздки. Большая бороздка видна на модели снизу и сверху, малая бороздка — в центре. ДНК-ассоциированные белки (см. Рибосомы: элонгация, терминация, Механизм действия липофильных гормонов) взаимодействуют с наиболее доступными основаниями в области большой бороздки. Пространственные соотношения между остовом и основаниями более наглядно видны на модели одинарной цепи (справа). На всех моделях аденин окрашен в жёлтый цвет, а комплементарный ему тимин — в оранжевый. На виде сверху (в центре; одна цепь выше другой) основания просматриваются наиболее полно.

В определённых условиях ДНК может принимать А-конформацию (на схеме не приведена). При таком расположении сохраняется правая двойная спираль, однако в отличие от В-формы основания уже не перпендикулярны оси, а находятся под другим углом. В Z-конформации (на схеме не приведена), которая может образовываться в участках В-ДНК, богатых GC, расположение нуклеотидов совершенно иное: двойная спираль скручена влево, а остов имеет характерную зигзагообразную форму (отсюда Z-конформация, или Z-ДНК).


Биомолекулы. Нуклеиновые кислоты / Молекулярные модели ДНК и тРНК

Статьи раздела «Молекулярные модели ДНК и тРНК»:

Следущая статья   |   — Вернуться в раздел


Обмен фосфорных соединений / Вашему вниманию предлагается издание «Обмен фосфорных соединений».Обмен фосфорных соединений
Вашему вниманию предлагается издание «Обмен фосфорных соединений».
История биологической химии. Институционализация биохимии / Книга посвящена вопросам истории формирования научных организаций в области классической биохимии. Показано, как возникли периодическая печать, руководства и учебники, научные общества, институты и кафедры биохимического профиля. На основании обширного, впервые проанализированного материала показаноИстория биологической химии. Институционализация биохимии
Книга посвящена вопросам истории формирования научных организаций в области ...
Нанотехнология белков. Протоколы, оборудование, области применения / В этой книге, написанной ведущими экспертами, собраны последние достижения в разработке методов и приборов для нанобиотехнологии и их применения в геномике и протеомике. Описано множество приёмов и методов для исследования структуры и функции белков в наноразмерном масштабе, включая наноустройства, Нанотехнология белков. Протоколы, оборудование, области применения
В этой книге, написанной ведущими экспертами, собраны последние достижения в ...
Новейшие методы исследования биосистем / Книга охватывает широкий круг методов, таких как молекулярная динамика, жидкостная хроматография, масс-спектрометрия, рентгено-структурный анализ, инфракрасная спектроскопия, просвечивающая и растровая электронная микроскопия, биофизические нанотехнологии, протеомика. Монография насыщена новейшими пНовейшие методы исследования биосистем
Книга охватывает широкий круг методов, таких как молекулярная динамика, ...