Б. Пируватдегидрогеназный комплекс Escherichia coli

Пируватдегидрогеназный комплекс (ПДГ-комплекс) бактерии Escherichia coli достаточно подробно исследован. Он имеет молекулярную массу от 5,3×10⁶ Да и диаметр больше 30 нм, то есть ПДГ-комплекс крупнее, чем рибосома. Комплекс состоит из 60 полипептидов (1, 2): 24 молекулы Е2 (8 тримеров) образуют ядро комплекса кубической формы. Каждая из 6 граней этого куба занята димерами (возможно, тетрамерами) компонентов E3, в то время как на 12 рёбрах куба лежат димеры молекул Е1. Другие дегидрогеназы кетокислот построены аналогично, но могут отличаться числом субъединиц и молекулярной массой.

Пространственная организация составных частей комплекса очень важна для катализа. Кофермент, липоевая кислота, очень подвижен благодаря образованию связи с лизиновым остатком фермента Е2. «Ручка» липоамида длиной примерно 1,4 нм в процессе катализа перемещается между E1 и E3 (3). Липоамид таким способом может взаимодействовать как со связанным в Е1 тиаминдифосфатом, так и с растворимым коферментом А и акцептирующим электроны ФАД в E3. Белковый домен ацетилтрансферазы, который связывает липоевую кислоту, очень гибок. Это дополнительно повышает дальность действия липоамидной «ручки».

Регуляция ПДГ-комплекса организма животных обсуждается в статье Гликолиз.

Статьи раздела «Дегидрогеназы кетокислот»:

• Дегидрогеназы кетокислот
• А. Пируватдегидрогеназа: реакция
• Б. Пируватдегидрогеназный комплекс Escherichia coli

— Следущая статья   |   — Вернуться в раздел