Пояснения
В этом разделе приведены 13 метаболических карт, на которых в компактной и схематической форме представлены основные метаболические пути. Карты не сопровождаются какими-либо дополнительными пояснениями.
- Цикл Кальвина (хлоропласты)
- Углеводный обмен
- Биосинтез жиров и мембранных липидов
- Биосинтез кетоновых тел и стероидов
- Распад жиров и фосфолипидов (ферментативная деградация)
- Биосинтез незаменимых аминокислот
- Биосинтез заменимых аминокислот
- Деградация аминокислот (карта I)
- Деградация аминокислот (карта II)
- Конверсия аммиака
- Биосинтез пуриновых нуклетидов
- Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов и перенос C1-фрагментов
- Распад мононуклетидов
Метаболические карты:
— содержат описание метаболических путей, которые в основной части книги по причине экономии места приведены в общем виде. В особенности это касается путей биосинтеза и деградации аминокислот и нуклеотидов, и отчасти углеводного и липидного обмена;
— позволяют получить полное представление о конкретном метаболическом пути, образующихся промежуточных и конечных соединениях, а также о ферментах, катализирующих биохимические реакции;
— могут служить справочным материалом, позволяющим определить место известных веществ в метаболических путях.
Важнейшие промежуточные соединения на схемах пронумерованы. Соответствующие соединения можно легко идентифицировать с помощью сопутствующей таблицы.
Для каждой биохимической реакции приводится классификационный код соответствующего фермента. Названия и коды ферментов приведены также в систематизированном списке ферментов, в котором все упомянутые в тексте ферменты расположены в соответствии с их кодом. Для идентификации ферментов рекомендуется также пользоваться предметным указателем.
Для реакций с участием коферментов приводятся названия коферментов (частично в тривиальном варианте). Для наиболее важных начальных, промежуточных и конечных соединений приведены полные названия или формулы.
Пример
На первой метаболической карте наверху слева приведён начальный этап темновой реакции фотосинтеза (цикл Кальвина).
Согласно этой реакции из одной молекулы рибулозо-1,5-дифосфата (метаболит 1) и одной молекулы CO2 (метаболит 2) образуются две молекулы 3-фосфоглицерата (метаболит 3).
Код соответствующего фермента 4.1.1.39. Из списка ферментов следует, что речь идёт о рибулозо дифосфат-карбоксилазе/оксигеназе (РДФКО, «рубиско» или 3-фосфо-D-глицерат-карбоксилазе), ключевом ферменте восстановительного пентозо-фосфатного цикла ассимиляции углерода при автотрофии. РДФКО принадлежит к классу 4 (лиазы) и в пределах этой группы к подклассу 4.1 (карбоксилиазы). В качестве кофактора фермент содержит медь ([Cu]).
Структура:
Списки:
Сложность материала:
Величины и единицы:
Микроэлементы в окружающей среде. Биогеохимия, биотехнология и биоремедиация Книга посвящена анализу роли микроэлементов (металлов и металлоидов) в ...
Анализ биологических последовательностей Предлагаемая книга отражает современное состояние сравнительно новой, но весьма ...